Το ΕΚΤ είναι ένας θεσμικός οργανισμός, νομικό πρόσωπο ιδιωτικού δικαίου, που εποπτεύεται από το Υπουργείο Ψηφιακής Διακυβέρνησης. Η αποστολή του περιστρέφεται γύρω από την υποστήριξη της έρευνας, της καινοτομίας και του ψηφιακού μετασχηματισμού, μέσω της συγκέντρωσης, οργάνωσης, τεκμηρίωσης, διάχυσης και διατήρησης ψηφιακού περιεχομένου — επιστημονικού, τεχνολογικού και πολιτισμικού χαρακτήρα — που παράγεται στην Ελλάδα.